消化科包括消化专科门诊、专科病房和消化内镜室（即胃肠镜等）。消化内镜诊疗部配备有多种先进的和新型的内镜，进行消化内镜操作的医生均为消化内科专科医生，所有护士均须接受严格的培训。

除开展常规的普通内镜和无痛内镜诊断外，还开展了以下诊疗项目，大大提高了消化道疾病尤其是消化道癌前病变或早癌的检出率及其微创治疗率：

色素内镜（包括电子染色NBI和FICE及化学染色）、放大内镜、双气囊小肠镜、胶囊内镜、超声内镜；

急诊镜下止血、取异物；

肝硬化食道静脉曲张套扎、胃底静脉曲张组织胶注射硬化；

消化道狭窄扩张、晚期肿瘤支架扩张、吻合口瘘支架置入堵瘘、空肠营养管置入、肠梗阻导管置入；

消化道广基息肉、早癌、间质瘤内镜下切除（EMR/ESD/MBM）、氩离子凝固术（APC）；

胆囊术后综合征、胆总管结石或蛔虫、胆源性胰腺炎、晚期胆胰肿瘤减黄的内镜诊断和微创治疗（ERCP/EST/ENBD/ERBD）等；

贲门失迟缓症的内镜下肌切开术（POEM）和内镜下食管经粘膜下隧道肿瘤切除术（STER）；

高分辨食管测压技术、24小时食管PH监测、肛门直肠测压和生物反馈治疗等。

与胃肠科合作开展内镜-腹腔镜联合术及术中内镜等。