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疑难遗传病全基因组测序简介

本文来源: 医学遗传中心

●检测临床意义:

近年来靶向测序和全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)得到广泛认可,逐渐成为辅助医生进行遗传病诊断的重要工具。这些检测手段尽管有效,仍然存在一些技术限制,特别是在检测结构变异等方面,导致目前仍有大量遗传病患者未获遗传学病因诊断。

本项目采用的全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),对受检者基因组中的全部DNA序列进行检测,较WES所覆盖的区域更广,不仅覆盖了几乎全部基因的外显子序列,也覆盖了内含子序列和基因间序列。可有效避免在对相关基因组区域进行靶向富集时产生的技术偏差,不仅可以检出单核苷酸变异,还可以对结构变异进行分析,并常规性地对线粒体基因组变异进行分析。因此,WGS应用于临床遗传诊断有望提高疑难病例的诊断率,缩短诊断流程,节省时间及降低反复诊疗产生的费用。


●检测适应症和禁忌症:

适应症:

1. 优先推荐送检WGS的适应症包括:高度怀疑患者有遗传病的可能(如临床症状、体征和其他检测结果提示,家族史阳性或近亲结婚家系),但先前经过如染色体核型、低深度全基因组测序/微阵列芯片或WES等一种或多种遗传学检测未获得明确的分子诊断;患者表型为非特异性(不明原因的智力落后和(或)发育迟缓、非已知综合征的多发畸形等)或临床诊断明确但目标疾病遗传异质性高(如先天性白内障、腓骨肌萎缩症、脑白质病等),为获得时间或经济效益而寻求一次性、全面性的遗传学检测(新生儿重症患儿等)。

2. 可使用WGS,但应结合具体情况选择优先的检测方法:目标疾病遗传异质性低,虽已有公认的靶向检测方法,但有可能部分致病变异(非编码区变异等)不在靶向检测的范围内。

禁忌症:

1. 输血后三个月内的患者;

2. 有造血干细胞移植史的患者;

3. 不适宜用WGS检测的遗传病种,包括:目标疾病致病基因的相当一部分变异类型不在WGS检测范围内,例如Beckwith-Wiedemann综合征等基因印迹疾病;目标疾病致病基因存在同源区域等情况,如先天性肾上腺皮质增生(CYP21A2基因相关)等。

●标本采集注意事项

1. 标本类型:EDTA-K2抗凝的外周静脉血2管,每管2-3ml。

2. 送检时间:

1)住院病人样本:周一至周五上午8:00-12:00,下午14:00-17:30,采样后由家属携带病历一并送至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口,并签署检测知情同意书;

2)普通门诊患者:周一至周五上午8:00-12:00,下午14:00-17:30,挂相应专科医生号(至本科室就诊可挂妇产科下“遗传咨询及产前诊断”医生号),开单缴费后,至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口,签署检测知情同意书并采血。

3)周六、周日送检样本需周五17:30前预约,预约电话(028)-87393280。

3. 报告时间:

60个自然日内。

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